xltmはマクロが有効なテンプレートファイルです。上書き保存しようとすると、名前を付けて保存のダイアログが現れます。xltmファイルを上書き保存するには、ファイルを開く時に "右クリック > 開く" で開く必要があります。

また、通常の開き方だとブック名の末尾に数字が付きますが、右クリックから開くとブック名の末尾に数字は付きません。